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空間產(chǎn)品

通過采用尖端的空間技術(shù),能夠在保持細胞原始空間位置的同時,精確分析和可視化基因表達和蛋白標記等,深入研究組織微環(huán)境中的細胞互作。

10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組(含Visium HD)

將基因空間表達可視化,在識別不同細胞群的同時保留空間背景,提供了關(guān)于組織微環(huán)境中細胞功能、表型和位置關(guān)系的關(guān)鍵信息。

Stereo-seq空間轉(zhuǎn)錄組

該技術(shù)通過時空芯片捕獲組織中的 mRNA,并通過空間條形碼(Coordinate ID,CID)還原回空間位置實現(xiàn)組織原位測序,為深入地了解細胞的基因表達及形態(tài)與局部環(huán)境之間的關(guān)系建立強大的研究基礎(chǔ)。

Akoya空間蛋白組

可提供同時檢測幾種(PhenoImager Fusion)到100多種(PhenoCycler-Fusion)生物蛋白標志物的解決方案,準確定位細胞空間分布、判斷細胞行為、識別不同的細胞聚集模式,實現(xiàn)組織原位超多靶點蛋白標記分析。

應(yīng)用方向
  • 腫瘤及免疫研究:有助于識別腫瘤微環(huán)境中的細胞相互作用,以及免疫細胞在腫瘤進展和治療反應(yīng)中的角色;
  • 病理學(xué)研究:通過在組織切片上進行高分辨率的分子表達分析,有助于揭示疾病的分子機制和組織中的病理變化;
  • 發(fā)育生物學(xué):通過分析發(fā)育過程中細胞在空間上的分布和基因表達變化,揭示細胞分化和組織形態(tài)形成的動態(tài)過程;
  • 空間圖譜:構(gòu)建器官和組織的空間圖譜,展示細胞在特定生理和病理狀態(tài)下的空間分布和相互作用,這對于理解復(fù)雜生物系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)和功能至關(guān)重要;
  • 生物標志物挖掘:通過分析細胞在特定組織環(huán)境中的表達模式,可以識別與疾病進程、治療響應(yīng)或預(yù)后相關(guān)的關(guān)鍵分子標志物;
產(chǎn)品優(yōu)勢
高分辨率實現(xiàn)亞細胞級分子定位

Stereo-seq、Visium HD和Akoya空間蛋白組均能達到亞細胞級的分辨率,實現(xiàn)對單個細胞及分子信息進行空間定位和檢測

揭示不同區(qū)域中細胞的組成及功能狀態(tài)

可視化腫瘤細胞、免疫細胞等多種細胞的亞型,詳細識別不同區(qū)域中的免疫細胞的分布及組成,可實現(xiàn)同時展示樣本間以及不同區(qū)域的差異和功能狀態(tài)

更深層次理解組織微環(huán)境,發(fā)現(xiàn)罕見細胞和生物標志物

根據(jù)對腫瘤切片樣本中單細胞分辨率下目標分子標志物的表達定位,精確鑒定目標細胞類型的分布,繪制腫瘤免疫微環(huán)境景觀圖譜,可發(fā)現(xiàn)以往容易忽略的罕見細胞、微小結(jié)構(gòu)

案例解析

頭頸部鱗狀細胞癌(HNSCC)腫瘤微環(huán)境空間激活途徑

單細胞聯(lián)合空間轉(zhuǎn)錄組揭示頭頸鱗狀細胞癌腫瘤微環(huán)境中增殖型耗竭CD8+T細胞作用

 

該研究利用單細胞水平的多組學(xué)技術(shù)構(gòu)建了人頭頸鱗狀細胞癌的多維度腫瘤微環(huán)境圖譜,從中鑒定出了一群具有增殖潛能并能持續(xù)發(fā)揮抗瘤效應(yīng)的新增殖型耗竭CD8+T細胞,并深入解析了其在腫瘤微環(huán)境中的作用機制。本研究系統(tǒng)性地解析了頭頸鱗狀細胞癌微環(huán)境中增殖型耗蝎CDB+T細胞的多維度特征,證實了其豐度與HPV陽性頭頸鮮狀細胞癌患者預(yù)后間的關(guān)聯(lián)性,以耗竭CD8+T細胞異質(zhì)性為切入點,為HPV感染狀態(tài)如何影響CDK4抑制劑對頭頸鮮狀細胞癌的療效提供了新的解釋,有助于推動頭頸鮮狀細胞癌精準治療的進一步發(fā)展。

參考文獻:Cheng D, Qiu K,Rao Y. et al. Proliferative exhausted CD8+ T cells exacerbate long-lasting anti-tumor effects in human papillomavirus-positive head and neck squamous cell carcinoma [J]. Elife. 2023 Feb 22:12:e82705.

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